Pałac Krzysztofory funkcjonuje jako oddział MHK od roku 1965. Jednak początki jego istnienia sięgają średniowiecza, kiedy to za patrona kamienicy obrano Św. Krzysztofa, od którego imienia nazwano to miejsce. W XVII wieku z połączenia gotyckich kamienic powstały zabudowania pałacowe. Pałac gościł wiele słynnych postaci, które zapisały się na kartach historii Polski, między innymi Jana Kazimierza Wazę, Michała Korybuta Wiśniowieckiego, Stanisława Augusta, księcia Józefa Poniatowskiego, biskupa Kajetana Sołtyka, Jana Tyssowskiego i wielu innych. Wystawa stała prezentowana w Pałacu Krzysztofory nosi tytuł "Z dziejów i kultury Krakowa".
