Muzeum Tradycji Niepodległościowych tworzą trzy oddziały: Więzienie Polityczne, Oddział Martyrologi Radogoszcz oraz Stacja Radegast.
Muzeum organizuje obok wystaw stałych także ekspozycje czasowe. Każdej wystawie towarzyszy katalog, bądź folder. Muzeum aktywnie współpracuje z wieloma organizacjami kombatanckimi, naukowymi, środowiskiem kolekcjonerów.
Pracownicy muzealni prowadzą szeroką akcję prelekcji i odczytów, lekcji muzealnych. Są autorami licznych opracowań naukowych i popularno-naukowych.